微量/臨床基因組DNA快速提取試劑he
本試劑盒采用特制的進(jìn)口DNA吸附柱和du特的緩沖液系統(tǒng),特別適合于從微量血液、法醫(yī)材料、干血點(diǎn)、藥簽、口香糖、尿液等微量樣品中分離純化基因組DNA。微量/臨床基因組DNA快速提取試劑he
臨床基因組DNA快速提取試劑盒(離心柱型)
微量/臨床基因組DNA快速提取試劑he
目錄號(hào):40215
目錄編號(hào) | 包裝單位 |
40215-50 | 50次 |
v 適用范圍:
適合于從微量血液、法醫(yī)材料、干血點(diǎn)、藥簽等微量樣品中分離純化基因組DNA。
v 試劑盒組成、儲(chǔ)存、穩(wěn)定性:
試劑盒組成 | 保存 | 50次 |
裂解液ML | 室溫 | 11ml |
結(jié)合液CB | 室溫 | 15ml |
抑制物去除液IR | 室溫 | 25ml |
漂洗液WB | 室溫 | 10ml 第一次使用前按說(shuō)明加指ding量乙醇 |
Carrier RNA | -20℃ | 310μg |
洗脫緩沖液EB | 室溫 | 10ml |
蛋白酶K fen(可選) 20mg/ml | -20℃ | 20mg |
吸附柱AC和收集管 | 室溫 | 50套 |
本試劑盒在室溫儲(chǔ)存12個(gè)月不影響使用效果
儲(chǔ)存事項(xiàng):
1. 結(jié)合液CB或者抑制物去除液IR低溫時(shí)可能出現(xiàn)析出和沉淀,可以在37℃水浴幾分鐘幫助重新溶解,恢復(fù)澄清透明后冷卻到室溫即可使用。
2. 為避免降低活性,方便運(yùn)輸,提供蛋白酶K為凍干粉狀,收到后,可短暫離心后,加入1毫升滅菌水溶解。因?yàn)榉磸?fù)凍融可能會(huì)降低酶活性,因此溶解后立即按照每次使用量(20微升)分裝凍存,-20℃保存。
3. Carrier RNA 收到時(shí)為凍干粉狀,使用前按照注意事項(xiàng)4配制和儲(chǔ)存。
4. 避免試劑長(zhǎng)時(shí)間暴露于空氣中發(fā)生揮發(fā)、氧化、pH值變化,各溶液使用后應(yīng)及時(shí)蓋緊蓋子。仔細(xì)閱讀注意事項(xiàng)4。
v 產(chǎn)品介紹:
本試劑盒采用特制的進(jìn)口DNA吸附柱和du特的緩沖液系統(tǒng),特別適合于從微量血液、法醫(yī)材料、干血點(diǎn)、藥簽、口香糖、尿液等微量樣品中分離純化基因組DNA。各種來(lái)源樣品裂解消化處理后DNA在高離序鹽狀態(tài)下選擇性吸附于離心柱內(nèi)硅基質(zhì)膜(特別配備了Carrier RNA可以從體系中輕松捕獲微量核酸),再通過(guò)一系列快速的漂洗-離心的步驟,將鹽、細(xì)胞代謝物、蛋白等雜質(zhì)去除,最后低鹽的洗脫緩沖液將純凈的基因組DNA從硅基質(zhì)膜上洗脫。純化后的DNA無(wú)雜質(zhì)和PCR抑制劑,可直接適用于PCR分析。
v 產(chǎn)品特點(diǎn):
1. 不需要使用有毒的苯fen等試劑,也不需要乙醇沉淀等步驟。
2. 節(jié)省時(shí)間,簡(jiǎn)捷,單個(gè)樣品操作一般可在20分鐘內(nèi)完成。
3. 配備了Carrier RNA 用于充分收集特別微量DNA。
4. 多次柱漂洗確保高純度,提取的DNA 純度高,質(zhì)量穩(wěn)定可靠,可適用于各種常規(guī)操作,包括PCR、酶切、測(cè)序、Southern 雜交等。
v 注意事項(xiàng):
1. 所有的離心步驟均在室溫完成,使用轉(zhuǎn)速可以達(dá)到13,000rpm的傳統(tǒng)臺(tái)式離心機(jī),如Eppendorf 5415C 或者類似離心機(jī)。
2. 開(kāi)始實(shí)驗(yàn)前將需要的水浴先預(yù)熱到所需溫度備用。部分樣品需要準(zhǔn)備1M DTT。
3. 結(jié)合液CB 和抑制物去除液IR中含有刺激性化合物,操作時(shí)戴乳膠手套,避免沾染皮膚、眼睛和衣服。若沾染皮膚、眼睛時(shí),要用大量清水或者生理鹽水沖洗。
4. Carrier RNA :
1) Carrier RNA收到時(shí)為凍干狀,使用時(shí)加入310μl RNase free 水充分溶解,配制成1μg/μl 溶液。Carrier RNA溶液應(yīng)避免反復(fù)凍融,凍融次數(shù)不能超過(guò)3 次。所以建議在第一次使用時(shí)按自己每次的用量分裝在RNase-free 的離心管中后置于-20℃儲(chǔ)存。
2) Carrier RNA使用方法:如果起始處理量很少(例如小于10μl全血和法醫(yī)樣品),我們推薦使用Carrier RNA,如果預(yù)期有較大量DNA產(chǎn)量,用戶可以根據(jù)需要選擇是否加入Carrier RNA。使用時(shí)在每個(gè)樣品提取所需結(jié)合液CB 中加入1μl Carrier RNA儲(chǔ)存溶液, 將結(jié)合液CB 與Carrier RNA溶液充分顛倒混勻即可(結(jié)合液CB容易起泡沫,請(qǐng)勿使用渦旋振蕩混勻)。也可根據(jù)樣品數(shù)量,在總共需要的結(jié)合液CB中加入總共需要的Carrier RNA混勻備用。混合液在室溫24小時(shí)內(nèi)穩(wěn)定。
3) Carrier RNA加入過(guò)多造成DNA洗脫液中Carrier RNA濃度過(guò)高,下游PCR反應(yīng)可能受干擾,加入過(guò)少可能并不能幫助提高DNA產(chǎn)量和PCR敏感度,因此加入量應(yīng)該在具體試驗(yàn)中調(diào)整以得到優(yōu)良效果。
4) 由于Carrier RNA 本身是小核酸,所以得到的基因組測(cè)定OD260 值會(huì)比真實(shí)值偏大,建議將得到的基因組直接用PCR 進(jìn)行檢測(cè)。
v 操作步驟:(實(shí)驗(yàn)前請(qǐng)先閱讀注意事項(xiàng))
提示:第一次使用前請(qǐng)先在15ml漂洗液WB中加入60ml無(wú)水乙醇,充分混勻,加入后請(qǐng)及時(shí)在方框打鉤標(biāo)記已加入乙醇,以免多次加入!
1. 血液樣品
a. 取1-100μl血液到1.5ml 的離心管中。
b. 如果不足100μl,加入裂解液ML補(bǔ)足到100μl。
c. 加入10μl的蛋白酶K (20mg/ml)溶液,充分混勻,再加入100μl結(jié)合液CB,立刻渦旋振蕩充分混勻,在70℃放置10分鐘。
如果處理樣品<10μl,建議在100μl結(jié)合液CB 中加入1μl Carrier RNA儲(chǔ)存溶液。
d. 冷卻后加入50μl無(wú)水乙醇,立刻渦旋振蕩充分混勻,室溫放置3分鐘。
如果周圍環(huán)境高于25℃,乙醇需要冰上預(yù)冷后再加入。
e. 接操作步驟項(xiàng)下7。
2. 干血點(diǎn)
a. 用打孔機(jī)打孔的方法在血卡(上面有干血點(diǎn)) 上沖取3mm(1/8英寸) 直徑血卡小片(上面有干血點(diǎn)),最多將3個(gè)直徑3mm血卡小片放入1.5ml 的離心管中。
一般血液應(yīng)該點(diǎn)在特定紙或者血卡上面干燥,如903 paper or IsoCode paper (Schleicher & Schuell), BloodstainCard or FTA Card (Whatman), Guthrie test cards, or comparable blood cards.
b. 加入180μl裂解液ML。
c. 加入20μl的蛋白酶K (20mg/ml)溶液,立刻渦旋振蕩充分混勻。
d. 56℃軌道搖床上面900rpm振搖1小時(shí)。
如果沒(méi)有可加熱軌道搖床,可以在水浴或者h(yuǎn)eating block上面進(jìn)行,每10分鐘渦旋振蕩10秒幫助裂解。
e. 加入200μl結(jié)合液CB,立刻渦旋振蕩充分混勻。
如果只處理一個(gè)3mm血卡小片,建議在200μl結(jié)合液CB 中加入1μl Carrier RNA儲(chǔ)存溶液。
f. 70℃軌道搖床上面900rpm振搖10分鐘。
如果沒(méi)有可加熱軌道搖床,可以在水浴或者h(yuǎn)eating block上面進(jìn)行,每3分鐘渦旋振蕩10秒幫助裂解。
g. 接操作步驟項(xiàng)下7。
3. 組織樣品
a. 新鮮或者解凍的組織在液氮中研磨成細(xì)粉后或者用解剖dao切成小碎塊(切成微塊可以提高產(chǎn)量)后取<10mg,轉(zhuǎn)入裝有180μl裂解液ML的1.5ml離心管中,用大口徑槍頭吹打混勻。
b. 加入20μl的蛋白酶K溶液(20mg/ml),立刻渦旋振蕩充分混勻。
c. 將裂解物放置在56℃水浴過(guò)夜或者直到組織消化wan全,期間輕柔的振蕩幾次幫助裂解。
對(duì)于小量的組織,一般4-6小時(shí)即可,但是過(guò)夜消化可以得到優(yōu)良結(jié)果。
d. 加入200μl 結(jié)合液CB,立刻渦旋振蕩充分混勻。
如果處理樣品量少, 建議在200μl結(jié)合液CB 中加入1μl Carrier RNA儲(chǔ)存溶液。
e. 冷卻后加200μl 無(wú)水乙醇,立刻渦旋振蕩充分混勻,室溫放置5分鐘。
如果周圍環(huán)境高于25℃,乙醇需要冰上預(yù)冷后再加入。
f. 接操作步驟項(xiàng)下7。
4. 口香糖
a. 將30mg口香糖切成小塊放入1.5ml離心管,加入280μl裂解液ML和20μl的蛋白酶K溶液(20mg/ml),立刻渦旋振蕩充分混勻。
b. 56℃軌道搖床上面900rpm振搖至少3小時(shí)。
如果沒(méi)有可加熱軌道搖床,可以在水浴或者h(yuǎn)eating block上面進(jìn)行,每10分鐘渦旋振蕩10秒幫助裂解。
c. 加入200μl 結(jié)合液CB(加入1μl Carrier RNA),立刻渦旋振蕩充分混勻。
d. 70℃軌道搖床上面900rpm振搖1小時(shí)。
如果沒(méi)有可加熱軌道搖床,可以在水浴或者h(yuǎn)eating block上面進(jìn)行,每10分鐘渦旋振蕩10秒幫助裂解。
e. 冷卻后加200μl無(wú)水乙醇,立刻渦旋振蕩充分混勻。
f. 最高速(約14,000rpm)離心1分鐘,取上清加入一個(gè)吸附柱AC中,(吸附柱放入收集管中)13,000rpm離心30-60秒,倒掉收集管中的廢液。
g. 接操作步驟項(xiàng)下8。
5. 法醫(yī)材料
a1. 剪下1 cm2煙頭或者過(guò)濾嘴外層紙,切成6小塊放入1.5ml離心管,加入300μl裂解液ML和20μl的蛋白酶K溶液(20mg/ml),立刻渦旋振蕩充分混勻。接步驟b。
a2. 剪下0.5-2.5 cm2信封或者郵票,切成小塊放入1.5ml離心管,加入300μl裂解液ML和20μl的蛋白酶K溶液(20mg/ml),立刻渦旋振蕩充分混勻。接步驟b。
a3. 從毛發(fā)根部毛囊處開(kāi)始剪下0.5-1 cm長(zhǎng)度毛發(fā)放入1.5ml離心管,加入280μl裂解液ML和20μl的蛋白酶K溶液(20mg/ml)和20μl 1M DTT溶液,立刻渦旋振蕩充分混勻。接步驟b。
a4. 將指甲剪成小塊放入1.5ml離心管,加入280μl裂解液ML和20μl的蛋白酶K溶液(20mg/ml)和20μl 1M DTT溶液,立刻渦旋振蕩充分混勻。接步驟b。
a5. 將約0.5cm2信封沾染了血液、唾液、精液的材料剪成小塊放入1.5ml離心管,加入300μl裂解液ML和20μl的蛋白酶K溶液(20mg/ml) (如果是精液需另加入20μl 1M DTT溶液),立刻渦旋振蕩充分混勻。接步驟b。
b. 56℃軌道搖床上面900rpm振搖1小時(shí)。
如果沒(méi)有可加熱軌道搖床,可以在水浴或者h(yuǎn)eating block上面進(jìn)行,每10分鐘渦旋振蕩10秒幫助裂解。
一般毛發(fā)1小時(shí)裂解可以完成,如果不wan全可以延長(zhǎng)時(shí)間。指甲等難裂解物建議過(guò)夜裂解。最后沒(méi)有裂解的不溶物在后續(xù)步驟e中會(huì)通過(guò)離心去除。
c. 加入200μl結(jié)合液CB(加入1μl Carrier RNA),立刻渦旋振蕩充分混勻。
d. 70℃軌道搖床上面900rpm振搖1小時(shí)。
e. 最高速(約14,000rpm)離心1分鐘,取上清加入一個(gè)吸附柱AC中,(吸附柱放入收集管中)13,000rpm離心30-60秒,倒掉收集管中的廢液。
f. 接操作步驟項(xiàng)下8。
6. 微切割樣品(包括福爾馬林固定的微切割樣品)
a. 加入15μl裂解液ML 到0.2 ml 離心管中,放入微切割樣品。
b. 加入10μl的蛋白酶K溶液(20mg/ml) ,立刻渦旋振蕩充分混勻。
c. 56℃水浴3小時(shí)(福爾馬林樣品16小時(shí))至裂解wan全,中間不時(shí)顛倒渦旋。
d. 加入15μl裂解液ML,再加入50μl結(jié)合液CB(加入1μl Carrier RNA),立刻渦旋振蕩充分混勻。
e. 冷卻后加入50μl無(wú)水乙醇,立刻渦旋振蕩充分混勻,室溫放置5分鐘。
如果周圍環(huán)境高于25℃,乙醇需要冰上預(yù)冷后再加入。
f. 接操作步驟項(xiàng)下7。
7. 將上一步混合物(包括可能有的沉淀)加入一個(gè)吸附柱AC中,(吸附柱放入收集管中)13,000rpm離心30-60秒,倒掉收集管中的廢液。
8. 加入500μl抑制物去除液IR,12,000rpm 離心30秒,棄廢液。
9. 加入500μl漂洗液WB(請(qǐng)先檢查是否已加入無(wú)水乙醇!),12,000rpm 離心30秒,棄掉廢液。
10. 加入500μl漂洗液WB,12,000rpm 離心30秒,棄掉廢液。
11. 將吸附柱AC放回空收集管中,13,000rpm離心2分鐘,盡量除去漂洗液,以免漂洗液中殘留乙醇抑制下游反應(yīng)。
12. 取出吸附柱AC,放入一個(gè)干凈的離心管中,在吸附膜的中間部位加20-50μl洗脫緩沖液EB(洗脫緩沖液事先在65-70℃水浴中預(yù)熱效果更好),室溫放置2-5分鐘,12,000rpm 離心1分鐘。將得到的溶液重新加入離心吸附柱中,室溫放置2分鐘,12,000rpm離心1分鐘。
洗脫體積越大,洗脫效率越高,如果需要DNA濃度較高,可以適當(dāng)減少洗脫體積, 但是最小體積不應(yīng)少于20μl,體積過(guò)小降低DNA洗脫效率,減少DNA產(chǎn)量。
13. DNA可以存放在2-8℃,如果要長(zhǎng)時(shí)間存放,可以放置在-20℃。
v 問(wèn)題與解決方法
問(wèn)題 | 評(píng)論與建議 |
DNA產(chǎn)量低或者洗脫液中無(wú)DNA | *Carrier RNA沒(méi)有加入到結(jié)合液CB-建議:仔細(xì)閱讀注意事項(xiàng)4。 *樣品凍融超過(guò)1次-建議:盡量使用新鮮樣品和凍融不超過(guò)1次的樣品。 *樣品在室溫放置過(guò)久-建議:盡快處理樣品或者低溫適當(dāng)方式保存。 *裂解不wan全,蛋白酶K失效了-建議:收到蛋白酶K后,按照每次使用量分裝凍存,避免反復(fù)凍融。 *結(jié)合液CB和Carrier RNA沒(méi)有充分混勻-建議:充分顛倒混勻。 *試劑和樣品沒(méi)有充分混勻-建議:加入每個(gè)試劑后都要充分混勻。 *洗脫效率不高-建議:確保做了步驟11,否則殘留乙醇會(huì)影響洗脫效率,仔細(xì)閱讀步驟12和只使用洗脫緩沖液EB洗脫。 |
DNA的下游反應(yīng)如PCR效果不佳 | * DNA產(chǎn)量低或者洗脫液中無(wú)DNA-建議:在下游反應(yīng)中增加DNA用量。 * 洗脫液中太多或者太少的Carrier RNA-建議:確定在下游應(yīng)用中Carrier RNA的最大允許量,調(diào)整結(jié)合液CB中加入Carrier RNA的用量。仔細(xì)閱讀注意事項(xiàng)4。 * 降低的靈敏度-建議:確定在下游PCR應(yīng)用中DNA洗脫液的最大允許用量,減少或者增加DNA洗脫液在PCR反應(yīng)中的用量,DNA洗脫體積也可以相應(yīng)的調(diào)整。 |
DNA下游酶切 | *離心柱殘留有較多乙醇或者底部不慎沾有乙醇抑制了酶切反應(yīng)-建議:確保做了步驟11,然后空氣中晾幾分鐘,讓殘留乙醇揮發(fā)。 *一些硅基質(zhì)膜成分一起洗脫下來(lái),抑制了酶切反應(yīng)-建議:將洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鐘,小心取上清使用。 |
A260吸光值 | *一些硅基質(zhì)膜成分一起洗脫下來(lái),干擾了吸光值-建議:將洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鐘,小心取上清使用。 |
微量/臨床基因組DNA快速提取試劑he